第1节 护卫长尼布撒拉旦在拉玛将耶利米释放以后，从耶和华那里有话临到耶利米。那时他在耶路撒冷和犹大一切被掳到巴比伦去的人中间，被锁链捆着带去。 “有话临到”是本书新一部分的标题（耶41:1-18；42:1-22；43:1-13；44:1-30），就是城陷以后，对犹大地和埃及之犹太人所发的预言，并夹杂历史记述。预言本身直到耶42:7才开始，前面的历史是它的引言。 “耶利米……被锁链捆着”：他虽已从护卫兵院中获释（见耶39:14注），但在焚城时的混乱中，似乎仍与其余被掳的人一同被锁链带走，直到到了拉玛才完全得自由。尼布撒拉旦在便雅悯的拉玛设营，并在那里聚集被掳的人，然后再迁往巴比伦（耶31:15）。他释放耶利米，是遵行王的命令（耶39:11-12）。耶利米暂时所受的“锁链”，或者是因那些受托看管他之人的疏忽，或者是尼布撒拉旦想借此责备百姓，指出他们竟将耶利米囚禁，是何等悖逆忘恩（加尔文）；因此，他在耶40:2-3里所说的话，不但是对耶利米说的，也是对百姓说的（“你们……你们”）。
第2节 护卫长将耶利米叫来，对他说：“耶和华你的神曾说要降这祸与此地。” “耶和华你的神曾说要降这祸与此地。” 巴比伦人在某种程度上知道，借着耶利米的预言（耶39:11），他们是神向祂百姓发怒的工具。
第3节 现在耶和华使这事临到，照他所说的行了；因为你们得罪耶和华，没有听从他的话，所以这事临到你们。 “你们得罪了”：（见耶40:1注。）他的话是对犹太人说的，也同样是对耶利米说的。神使外邦人自己作见证，指证他们的罪（申29:24-25：“列国人必说：耶和华为何向此地这样行呢？这样大发烈怒是什么意思呢？人必回答说：是因这地的人离弃了耶和华他们列祖之神的圣约……”）。
第4节 现在，看哪，我今日解开你手上的锁链。你若看与我同到巴比伦去好，就来吧；我必厚待你。你若看与我同到巴比伦去不好，就不必去。看哪，全地在你面前，你看哪里好、哪里合宜，只管往那里去。 “我必厚待你”是尼布甲尼撒所吩咐的话原文（耶39:12）。 “全地在你面前，你看哪里好……就往那里去”，如同亚比米勒对亚伯拉罕所说的话一样（创20:15，旁注）。当其余的人不是被掳去，就是被迫留在当地时，唯有耶利米得了可以随意居住何处的选择权。
第5节 他还没有回去的时候，护卫长说：“你可以回到沙番的孙子、亚希甘的儿子基大利那里去，就是巴比伦王所立管理犹大城邑的，住在他那里，在民中间；或者你看哪里合宜，就往哪里去。”于是护卫长送给他粮食和礼物，放他去了。 “他还没有回去”是插入语。当耶利米犹豫不决，不知去哪里更好时，尼布撒拉旦便接着说：“那你就去基大利那里吧”，等等（并非如英文钦定本所译“也回去”），意思是：若你宁可留在这里，不愿同我去。 “粮食”参赛33:16：“他的粮必不缺乏。” “礼物”更准确是赠品。这对先知必是及时的帮助，因为他在围城中大概已失去所有。
第6节 于是耶利米往米斯巴，到亚希甘的儿子基大利那里去，住在境内剩下的民中。 米斯巴在便雅悯，位于耶路撒冷西北（耶41:5-6，9）；不是约旦河东基列的米斯巴（士10:17）。耶利米留在本国，与受苦的百姓同住，尽管犹太人对他忘恩负义，他仍不去外邦宫廷享受尊荣与快乐，这显明了他的爱国心与敬虔（来11:24-26）。这也证明他先前退避（耶37:12-14）之动机是纯正的。
第7节 在田野间的一切军长，就是他们和属下的人，听见巴比伦王立了亚希甘的儿子基大利作境内的省长，并将没有掳到巴比伦去的男人、妇女、孩童和境内极穷的人交给他管理， “田野间的军长”：西底家被掳时，犹大军队的首领分散在全国各处（耶52:8），为要躲避迦勒底人的耳目。
第8节 于是他们和属下的人都来到米斯巴见基大利，就是尼探雅的儿子以实玛利、加利亚的两个儿子约哈难和约拿单、单户篾的儿子西莱雅、尼陀法人以斐的众子，并玛迦人的儿子耶撒尼亚。 “尼陀法人”是指出自犹大的一座城尼陀法（撒下23:28）。“玛迦人”是指出自黑门山脚下的玛迦地（申3:14）。
第9节 沙番的孙子、亚希甘的儿子基大利向他们和属下的人起誓，说：“不要怕服事迦勒底人，只管住在这地，服事巴比伦王，就可以得福。” “不要怕”：他们惧怕自己从前的作为不能从迦勒底人那里得赦免，因此基大利用起誓向他们保证安全。 “服事”原文是“站在……面前”（参耶40:10；52:12旁注），即随时侍立，准备执行巴比伦王的命令。
第10节 至于我，我要住在米斯巴，侍立在那来到我们这里的迦勒底人面前；只是你们要收取酒、夏果和油，装在器皿里，住在你们所占的城邑中。 米斯巴位于巴比伦与犹大之间的通道上，因此便于处理两国之间的事务。 “至于我……只是你们”：他很有技巧地这样说，为要安抚他们，把服事迦勒底人的重担说成由自己承担，而他们则可以自由收取酒、果子和油。他此时没有补充说明，这些出产正是将来向巴比伦所纳贡赋的主要部分；因为巴比伦虽盛产谷物，却较少出产葡萄、无花果和橄榄（希罗多德，1:193）。“葡萄园”赐给“穷人”（耶39:10），会使那些心怀不满的人盼望享受最好的出产（耶40:12）。
第11节 同样，那些在摩押、亚扪人中、以东和各国中的犹太人，听见巴比伦王给犹大留下余民，又立亚希甘的儿子、沙番的孙子基大利管理他们。 本节JFB无注释。
第12节 这一切犹太人就从他们所赶到的各处回来，到了犹大地，到米斯巴见基大利，积蓄了许多酒和夏果。 “在摩押的犹太人……”就是那些在迦勒底人临近时逃往那里的。神如此调和祂刑罚的严厉，使仍有余民得以存留。
第13节 加利亚的儿子约哈难和在田野间的一切军长来到米斯巴见基大利。 “在田野间”就是不在城里，而是分散在乡间（耶40:7）。
第14节 对他说：“亚扪人的王巴利斯打发尼探雅的儿子以实玛利来要你的命，你确实知道吗？”只是亚希甘的儿子基大利不信他们的话。 “巴利斯”这名字出自偶像巴力，正如外邦人的名字中常有这样的情形。 “亚扪人”：以实玛利杀了基大利之后，正是逃往他们那里去（耶41:10）。 “要你的命”原文直译是“击打你的魂”，即致命的一击。 “以实玛利”：他是大卫王室的后裔（耶41:1），嫉妒基大利得了他自以为应得的统治地位，因此与犹大的古老外邦仇敌结盟。 “基大利不信他们的话”：这是慷慨却不明智、毫无疑心的表现（传9:16）。
第15节 加利亚的儿子约哈难在米斯巴私下对基大利说：“求你容我去杀尼探雅的儿子以实玛利，必没有人知道。何必让他杀你，以致聚集到你这里来的犹太人都被分散，在犹大所剩下的余民灭亡呢？” 本节JFB无注释。
第16节 亚希甘的儿子基大利对加利亚的儿子约哈难说：“你不可行这事，因为你论以实玛利所说的是假话。” “你论以实玛利所说的是假话”：这是护理中的一个奥秘，神竟容许义人虽然得了警告，仍这样奔入为他们设下的网罗。赛57:1“义人被收去，免了将来的祸患”似乎提示了一个解释。
评语：（1）尼布甲尼撒护卫长尼布撒拉旦，这位外邦人，既作为神的工具执行了神借着祂的使者耶利米所预言、临到耶路撒冷的审判，就转而劝诫那些被征服的犹太人：他们一切苦难的原因，乃是他们自己得罪了主。神借此何等鲜明地表明：临到祂古时百姓的毁灭，并非单单是人的作为，而是祂自己的作为，为要彰显祂永不改变的公义；这公义在祂选民违背祂永恒律例时，也不宽容他们。连外邦人都不得不看出并宣告这大真理。神的圣约百姓，竟要由一个不认识神的外邦统治者来提醒他们的罪，这是何等羞辱！凡自称有信仰的人，若与他们崇高的蒙召不相称而行，那些并不自称有信仰的世人，迟早必会看出他们的不一致，并以此攻击他们。
（2）耶利米在长期受人藐视和敌对之后，到此时才被正确地重视。外邦人辨认出他使命真正是出于神，而他本国的人却因刚硬瞎眼未能承认。同样，他真实的爱国心，就是先前那样被残酷猜忌的（耶37:12-21），此时也以最鲜明的色彩显明出来。当他可以自由选择去哪里时（耶40:4-5），他甘心自愿选择留在自己百姓中间，与他们一同面对深重的羞辱和苦难。他像从前的摩西一样，宁可和按神拣选为神子民的人一同受苦，也不愿享受外邦宫廷中摆在他面前的快乐和尊荣（来11:24-26）。真正的信仰，是真正爱国心最稳固的根基。
（3）耶路撒冷为自己的罪恶付上可怕代价之后不过片刻，犹太人的首领和领袖，如以实玛利和约哈难，就又开始策划新的强暴和流血阴谋（耶40:13-15）。只要骄傲、野心和报复仍藏在人的心里，人就会不停地设计新诡计，而这些诡计通常终究伤害自己。西底家背叛巴比伦王的叛乱，既已以极其可怕的结局收场，以实玛利却又谋划新的阴谋。惟有神全能而更新人的恩典，才能真正更新人的心和生命。
（4）与此同时，在现今秩序之下的奥秘之一，就是像基大利这样慷慨坦诚、动机正直的人，竟会被容许成为无耻凶残冒险者的牺牲品（耶40:16）。这正是堕落世界中有仇敌存在的诸多证据之一。信心的特权就在于：即使现在的表象似乎相反，仍能相信神正在安排万事，为着祂子民最终的益处；并且公义的审判很快就要来到，那时一切黑暗都必得澄清，神的作为都必得证明为义，罪与撒但并他的后裔都要永远被赶出，而那位 rightful King 真正合法的君王必拯救这地脱离以往一切错误统治和强暴。