第1节 耶和华对挪亚说：“你和你的全家都要进入方舟；因为在这世代中，我见你在我面前是义人。” 这里是对挪亚和他全家发出的恩慈邀请，叫他们进入安全之处，因为洪水将要来到。因为我见你在这世代中在我面前是义人，真正的义人乃是那些在神面前为义的人；他们不只有敬虔的外貌，借此在人前显为义，而人是很容易受蒙蔽的；他们也有敬虔的能力，借此向鉴察人心的神证明自己。
第2节 凡洁净的畜类，你要带七公七母；不洁净的畜类，你要带一公一母。这里对那些要与挪亚一同在方舟里保全性命的走兽，赐下了必要的命令。他必须谨慎保全每一种类，使任何一族类，哪怕是最微不足道的，也不至于从受造界中全然灭绝。由此可见：1. 神对人的顾念。神是顾念牛吗？林前9:9，还是说这顾念岂不更是为了人的缘故吗？2. 连不洁净的走兽也在方舟里被保全了性命，就是那些最没有价值的。因为神的怜悯覆庇他一切所造的，并不只是那些最有用处的。3. 然而洁净的比不洁净的保存得更多。1. 因为洁净的更为人的服事所用；所以出于对人的恩待，更多的被保留下来，并且直到如今仍在繁衍。感谢神，如今并没有像牛群那样成群的狮子，也没有像羊群那样成群的老虎。2. 因为洁净的可用来向神献祭；所以出于对神的尊荣，更多的被保留下来，三对用以繁殖，另加那第七只用以献祭，创8:20。
第4节 因为再过七天，我要降雨在地上四十昼夜，把我所造的各种活物都从地上除灭。再过七天，我要降雨，这事还要再过七天我才行。那一百二十年满了以后，神又给他们宽限七天，一方面显明他不轻易发怒，另一方面也给他们更多一点悔改的机会。但这一切都是徒然；这七天和先前所有的日子一样，仍被他们虚掷了，他们照旧安然无事，直到洪水来到的那一天。挪亚在远处向他们宣告审判的时候，他们还容易把悔改一再推延；但如今他奉命告诉他们，审判已到门口，他们只剩下一周可以回转，看看这最后是否能唤醒他们，去思想那与他们平安有关的事。然而，那些在健康年日里忽略自己灵魂的人，当他们远远看见死亡时既是如此疏忽；等到他们在疾病的几天里，就是那临近死亡的七天里，看见死亡逼近时，也常常仍旧一样疏忽，因为他们的心已因罪的诡诈而刚硬了。
第7节 挪亚就同他的儿子、妻子，和儿妇，都进入方舟，躲避洪水。挪亚和他的儿子、妻子、儿妇都进去了，走兽也都顺从地与他一同进去。当初把它们带到亚当面前叫他命名的那一只手，如今又把它们带到挪亚面前，使它们得蒙保全。
第11节 当挪亚六百岁，二月十七日那一天，大渊的泉源都裂开了，天上的窗户也敞开了。挪亚六百岁那一年，是从创造以来第一千六百五十六年。二月十七日，按推算大约是十一月初，所以挪亚在这之前刚刚收过庄稼，可以用来为方舟储备食物。就在那一天，大渊的泉源都裂开了，并不需要重新创造水；神早已把深渊收藏在库房里，诗33:7，如今他打开了那些库藏。神在创造时，曾为海水立定闩和门，使它不得再回来遮盖地面，诗104:9；伯38:9-11；如今他不过是挪去了这些古老的堤防和藩篱，海水便又回来遮盖大地，正如起初那样，创1:9。天上的窗户也敞开了，就是穹苍以上的水倾倒在世界上；那些神为患难之时、争战和打仗的日子所预备的宝库，伯38:22-23。平常雨水是一滴一滴降下来的，那时却是成流倾泻。我们读到伯26:8说，神将水包在密云中，云却不因其下坠裂；但如今这束缚被解开了，云层被撕裂了，于是降下了前所未有、后来也再没有过的暴雨。
第12节 雨降在地上四十昼夜。雨毫不停歇，也没有减弱，四十昼夜都如此，而且是同时降在全地之上。
第14节 它们和百兽，各从其类；一切牲畜，各从其类；地上一切爬物，各从其类；一切禽鸟，各从其类；凡有翅膀的活物都进去了。百兽各从其类，这用语正如创造历史中所用的措辞，创1:21；创1:24-25，是要表明：起初被创造了多少种类，如今就有多少种类得以保全，并不多也不少。
第20节 水势比山高过十五肘，山岭都淹没了。山岭都淹没了，因此可见洪水以前就已经有山了。
第21节 凡在地上行动的活物，就是飞鸟、牲畜、走兽，和地上所滋生的一切爬物，以及所有的人，都死了。凡有血肉的都死了，凡在旱地上、鼻孔里有气息的，连一切活物都死了。这是为什么呢？作恶的只是人，神的手公义地攻击人；但这些羊做了什么呢？我回答：1. 我们确信神并没有亏待它们。他是万有生命的主宰，因为他是生命惟一的泉源和创始者。那位照自己旨意造它们的，也可以照自己旨意使它们消亡；谁能对他说：“你作什么呢？”2. 神借着它们的毁灭，正如借着它们的创造一样，奇妙地成就了自己荣耀的旨意。在这事上，他的圣洁和公义大大彰显出来；由此可见他恨恶罪，对罪人极其不悦，因为连这些较低等的受造物，也因它们是人的仆役、是人产业的一部分，又因它们曾被人滥用，成了罪的工具，所以也与人一同灭亡。这同样也是神智慧的一个明证。受造物既是在造人的时候为人而造，也是在人数增多时为人而繁衍；所以如今既然人类减少到这样少的数目，那么兽类按比例减少也是合宜的，否则它们就会反而占了统治地位，遍满全地，而所剩下的人类余民就会被它们制伏。