第1节 太初有道，道与神同在，道就是神。太初——（指创世记 1:1 和箴言 8:23。）当万有藉着道开始被造的时候：在天地和这整个受造之物体系的开端，道就已经存在，没有任何起始。凡有开端的开始存在时，他就已经在那里。道——诗篇 33:6 如此称呼他，七十士译本和迦勒底意译本中也常如此称呼。因此，圣约翰并不是从斐洛或任何外邦作家那里借来这个说法。那时他还没有被称为耶稣，或基督。他就是父从永恒里所生出、所说出的那道；父藉着他说话而造万有；他又把父启示给我们。我们在约翰福音 1:18 里，既看见对道真实的描述，也看见他为何这样称呼的原因。他是父怀里的独生子，已将父表明出来。道与神同在——因此他与父神有分别。这里译作“与”的这个词，仿佛表示子在本体合一中永远趋向父。他单独与神同在；因为那时除神以外，再没有任何存在。道就是神——至高、永恒、独立。那时并没有任何受造物，使他可以在相对意义上被称为神。因此，这里是按绝对意义称他为神。弥赛亚的神性在旧约中已经清楚启示出来（耶利米书 23:7；何西阿书 1:6；诗篇 23:1），其余几位福音书作者主要在于证明耶稣这位真实的人就是弥赛亚。但后来既有人因此开始怀疑他的神性，于是圣约翰便明确宣告此事，并写下这卷书，仿佛是对诸福音的补充，正如《启示录》之于先知书一样。
第2节 这道太初与神同在。这道太初与神同在——这一节把前面提到的三点重述并浓缩为一点。好像他说：这道，就是那位神，太初就存在，并且与神同在。
第3节 万物是藉着他造的；凡被造的，没有一样不是藉着他造的。除神以外，万物都被造；而一切被造之物，都是藉着道造的。约翰福音 1:1-2 描述受造以前万有的状态；约翰福音 1:3 描述创造之时；约翰福音 1:4 描述人无罪时的状态；约翰福音 1:5 描述人败坏之后的状态。
第4节 生命在他里头；这生命就是人的光。生命在他里头——他既是一切活物生命的根基，也是凡存在之物得以存在的根基。这生命就是人的光——那位本是生命、又将生命赐给一切活物的，也就是人的光；在人原初的状态中，他是智慧、圣洁和福乐的泉源。
第5节 光照在黑暗里，黑暗却不接受光。光照在黑暗里——甚至照耀在堕落的人身上；但黑暗——黑暗、有罪的人，却不领悟这光。
第6节 有一个人，是从神那里差来的，名叫约翰。有一个人——福音书作者现在转到那位为光作见证的人，就是他在前五节所说之光的见证人。
第7节 这人来，为要作见证，就是为光作见证，叫众人因他可以信。这人来是为作（即，为了给出）见证——福音书作者以极强烈而温柔的感情，藉着高贵的插叙，把自己的见证与约翰的见证交织在一起；在这些插叙中，他解释施洗约翰的职分，一面在其简短语句之前预作说明，一面在之后补充更进一步的解释。马太、马可、路加按着先前的应许称之为“福音”，而圣约翰通常称之为“见证”，表明叙述者所知的确定性；为光作见证——就是为基督作见证。
第9节 那光是真光，照亮一切生在世上的人。照亮一切人——藉着通常所谓天然良心，至少指出善恶的大致界线。而这光，若人不拦阻，便会越来越明，直到日午。
第10节 他在世界，世界也是藉着他造的，世界却不认识他。他在世界——甚至自创造以来就是如此。
第11节 他到自己的地方来，自己的人倒不接待他。他来了——在日期满足的时候，到自己的地方——国家、城邑、圣殿；而自己的人——百姓，却不接待他。
第12节 凡接待他的，就是信他名的人，他就赐他们权柄，作神的儿女。凡接待他的——无论犹太人或外邦人；就是信他名的人——也就是信他自己。他们一信，就成为儿女；既是儿女，神就差他儿子的灵进入他们心里，呼叫：“阿爸！父！”
第13节 这等人不是从血气生的，不是从情欲生的，也不是从人意生的，乃是从神生的。这等人是生的——就是那些成为神儿女的人，不是从血气——不是因出于亚伯拉罕的后裔；也不是从情欲——藉着自然生育；也不是从人意——藉着人的收养；乃是从神——藉着他的灵生的。
第14节 道成了肉身，住在我们中间，充充满满地有恩典有真理。我们也见过他的荣光，正是父独生子的荣光。肉身有时指败坏的本性；有时指身体；有时，如这里，是指整个人。我们见过他的荣光——我们这些使徒，特别是彼得、雅各和约翰，路加福音 9:32。恩典和真理——我们生来都是说谎的，是可怒之子，对恩典和真理都一无所知。但当我们在那蒙爱者里面被接纳时，就有分于这些。整节可以这样意译：为了把我们提升到这样的尊荣和福乐，永恒的道以极其惊人的降卑成了肉身，使自己与我们悲惨的本性联合，承担其中一切无罪的软弱。他并不是短暂地来访问我们，而是在地上支搭帐幕住在我们中间，以比从前在摩西会幕中更显著的方式彰显他的荣光。而我们这些如今记录这些事的人，以极其专注的心见过他的荣光，所以可以作证：这荣光在各方面都与父的独生子相称。因为这荣光不仅在他登山变像时，和在他不断施行神迹时发出，也在他一生全部过程中的性情、服事和行为上显明出来。在这一切事上，他都显为充满恩典和真理：他自己极其慈爱正直；向罪人充分显明赦免，而这是摩西制度所不能做到的；并且真实赐下最实在的福分，而那制度不过是将来美事的影儿。
第15节 约翰为他作见证，喊着说：“这就是我曾说：‘那在我以后来的，反成了在我以前的，因他本来在我以前。’”约翰呼喊——带着喜乐和信心；“这就是我所说的”——约翰在我们主受洗以前已经这样说过，虽然那时他还不按外貌认识他；他是在主受洗时才第一次认出他，后来又呼喊说：“这就是我所说的”等等。“他成了在我以前的”——就其职分而言；“因他本来在我以前”——就其本性而言。
第16节 从他丰满的恩典里，我们都领受了，而且恩上加恩。而——这里使徒证实施洗约翰的话：仿佛他说，他确实在你以前：这也是我们所经历过的。我们众人——就是信的人：都领受了——我们所享有的一切，都是出于他的丰满；特别是，恩上加恩——一个福分接着一个福分，无量的恩典和爱。
第17节 律法本是藉着摩西传的；恩典和真理都是由耶稣基督来的。律法——引发忿怒并包含影儿；是藉着赐下的——从来没有哲学家、诗人或演说家像圣约翰那样准确地选择词语。他说：律法是藉着摩西赐下的；恩典是由耶稣基督来的。请注意各词这样安排的理由：摩西的律法不是他自己的；基督的恩典却是他自己的。他的恩典与忿怒相对；他的真理与律法影儿般的礼仪相对。耶稣——圣约翰既已在前面一次提到道成肉身（约翰福音 1:14），在全书中就不再用“道”这个名称了。
第18节 从来没有人看见神，只有在父怀里的独生子将他表明出来。从来没有人看见神——用肉眼不能；然而信徒却以信心的眼睛看见他。在父怀里——这个表达表示最高的合一，和最亲密的知识。
第19节 约翰所作的见证记在下面：犹太人从耶路撒冷差祭司和利未人到约翰那里，问他说：“你是谁？”犹太人——大概是大公会差来的。
第20节 他就明说，并不隐瞒；明说：“我不是基督。”我不是基督——因为许多人以为他就是。
第21节 他们又问他说：“这样，你是谁呢？是以利亚吗？”他说：“我不是。”“是那先知吗？”他回答说：“不是。”你是以利亚吗？——他不是他们所说的那位以利亚（提斯比人）。“是那先知吗？”——就是摩西在申命记 18:15 所说的那一位。
第23节 他说：“我就是那在旷野有人声喊着说：‘修直主的道路！’正如先知以赛亚所说的。”他说——我就是以赛亚所说那位基督的先锋。我就是声音——仿佛他说，我远不是基督，甚至也不是以利亚，我不过是一个声音：一种声音，一旦把它所表明的意思表达出来，就消散在空气中，不复被人知道。以赛亚书 40:3。
第24节 那些人是法利赛人差来的。那些奉差来的，是法利赛人——他们特别固守旧习，对任何新变都抱怀疑（除非是他们自己的文士引进的），除非倡导者有无可置疑的神圣权柄凭据。
第25节 他们就问他说：“你既不是基督，不是以利亚，也不是那先知，为什么施洗呢？”他们问他说：“那么你为什么施洗呢？”——既没有公会的委任？而且不单给外邦人施洗（外邦人向来是在受割礼之前先受洗），甚至也给犹太人施洗？
第26节 约翰回答说：“我是用水施洗，但有一位站在你们中间，是你们不认识的。”约翰回答说：“我施洗”——是为预备人迎接弥赛亚；并且也表明犹太人和外邦人一样，都必须归信基督，而这些人和那些人一样，都需要从罪中洗净。
第28节 这是在约但河外伯大巴喇，约翰施洗的地方作的。约翰施洗的地方——就是他惯常施洗的地方。
第29节 次日，约翰看见耶稣来到他那里，就说：“看哪，神的羔羊，除去世人罪孽的。”他看见耶稣来，就说：“看哪，这羔羊”——无辜的；将要被献上的；是以赛亚所预言的，以赛亚书 53:7，又是逾越节羔羊和每日祭牲所预表的。神的羔羊——是神所赐下、所悦纳、所接纳的；除去——为之赎罪；世人的罪——就是一切的罪：世人——全人类。罪与世界的范围同样广大。
第31节 我先前不认识他，如今我来用水施洗，为要叫他显明给以色列人。我先前不认识他——直到他来受洗时才认识。想到他们的关系如此亲近，并且二人的怀孕与出生都如此不寻常，这实在令人惊讶。但在我们救主从幼年到受洗一直住在拿撒勒这事上，显然有特别的护理；而约翰这期间一直在犹太旷野过隐修生活，路加福音 1:80，离拿撒勒有九十英里或更远：借此避免了他们之间可能有的熟识，否则约翰为基督作的见证就可能受到怀疑。
第34节 我看见了，就证明这是神的儿子。我看见了——就是看见圣灵这样降下并住在他身上。并且作见证——从那时起。
第37节 两个门徒听见他的话，就跟从了耶稣。他们跟从耶稣——在他后面走，却还没有勇气和他说话。
第41节 他先找着自己的哥哥西门，对他说：“我们遇见弥赛亚了。”（弥赛亚翻出来就是基督。）他先找着自己的哥哥西门——大概他们二人都在寻找他。弥赛亚翻出来就是基督——福音书作者补上这句话，约翰福音 1:38 那里“翻出来就是夫子”也是如此。
第42节 于是领他去见耶稣。耶稣看着他，说：“你是约拿的儿子西门，你要称为矶法。”（矶法翻出来就是彼得。）耶稣说：“你是约拿的儿子西门”——因为没有人把这些名字告诉我们的主，这不能不使彼得感到惊讶。矶法，就是彼得——在叙利亚语中的意思，与希腊语里的彼得相同，即“磐石”。
第45节 腓力找着拿但业，对他说：“摩西在律法上所写的和众先知所记的那一位，我们遇见了，就是约瑟的儿子拿撒勒人耶稣。”拿撒勒人耶稣——腓力当时这样想，并不知道他生在伯利恒。拿但业很可能就是巴多罗买，也就是多罗买的儿子。圣马太把巴多罗买和腓力连在一起，马太福音 10:3；而圣约翰在使徒中间提到拿但业，把他放在多马后面，约翰福音 21:2；这正如使徒行传 1:13 里巴多罗买所处的位置一样。
第46节 拿但业对他说：“拿撒勒还能出什么好的吗？”腓力说：“你来看！”拿撒勒还能出什么好的吗？——我们当何等谨慎防备流行的偏见！当这种偏见一旦占据了像拿但业这样诚实的心，就会使他因耶稣是在拿撒勒长大的，竟也怀疑这位可称颂的主是骗子。但他的正直胜过了那愚昧的偏向，使他愿意接受证据的力量；而坦诚的探求者，纵然因此得到的是最出人意料的发现，也总乐于接纳。还能出什么好的吗——意思是，我们从圣经中有什么根据可期待弥赛亚，或任何杰出的先知，出自拿撒勒吗？腓力说：“你来看”——这正是他前一天从主那里所领受的回答。
第48节 拿但业对耶稣说：“你从哪里知道我呢？”耶稣回答说：“腓力还没有招呼你，你在无花果树底下，我就看见你了。”我看见你在无花果树底下——也许是在祷告。
第49节 拿但业说：“拉比，你是神的儿子，你是以色列的王！”拿但业回答——那些乐意相信、敏于领受神的真理和恩典的人，是有福的。你是神的儿子——这样，他现在所承认的，比他从腓力那里听见的更多：神的儿子，以色列的王——这是对基督位格和职分的双重承认。
第51节 又说：“我实实在在地告诉你们，你们将要看见天开了，神的使者上去下来在人子身上。”你们将要看见——你和这一切人，就是如今在我卑微景况中信我的人，将来都要看见我在荣耀中降临，并有神的众使者与我同来。这似乎是这些话最自然的意思，虽然这些话也可能是指他的升天。