第1节 尼希米记 13:1 当日，他们念摩西的律法书给百姓听，遇见书上写着说，亚扪人和摩押人永不可入神的会。 当日。这并不是紧接着城墙和城门奉献之后立刻发生的事，而是在尼希米从波斯朝廷回到耶路撒冷之后；他离开的时间已经相当长。这里所描述的事，很可能发生在公开周期性宣读律法的某个场合；当时百姓的注意力特别被引向某些违犯律法、需要立即纠正的事。这里又提供了一个实例，补充说明公开、定期宣读神律法所带来的巨大益处。这本是为百姓宗教教导而设立的制度，为要传播对圣卷的知识与敬畏，也为除去那些随着时间流逝可能潜入其中的错误和败坏。亚扪人和摩押人永不可入神的会。这绝不是说这两国中归信的人不得享有在以色列敬拜真神的权利，而只是说他们不能并入以色列国，也不能与这百姓建立婚姻关系（申命记 23:3-4）。这次诉诸神圣律法权威的举动，导致了一切异教联盟的解除（尼希米记 9:2；以斯拉记 10:3）。
第2节 尼希米记 13:2 因为他们没有拿食物和水来迎接以色列人，且雇了巴兰咒诅他们；但我们的神使那咒诅变为祝福。 JFB对本节无注释。
第3节 尼希米记 13:3 以色列民听见这律法，就与一切闲杂人绝交。 就与以色列中一切闲杂人绝交，[`eereb (H6154)]，即犹太人与之结盟的那群成分混杂的外邦人。这个词首先用来指那些在他们出埃及时与他们一同离开埃及的埃及人（出埃及记 12:38；以及利未记 22:10-11）。
第4节 尼希米记 13:4 先是蒙派管理我们神殿中库房的祭司以利亚实与多比雅结亲， 先是。在公然忽视或违犯律法之下，这种杂婚的做法已经变得非常普遍，甚至连本该树立更好榜样的大祭司家族，也被这种不洁的混杂玷污了。祭司以利亚实，管理……我们神殿中的库房，就是在各门那里专门存放一切与圣殿事奉有关之物的那间库房或房间。祭司以利亚实，管理……我们神殿中的库房，就是在各门那里专门存放一切与圣殿事奉有关之物的那间库房或房间。与多比雅结亲。这人就是大祭司（尼希米记 12:28；另见尼希米记 3:1）；他因着自己尊贵的职分，监管并掌控圣殿附属的各个房间。他原则上的松弛以及行为上的松弛，从他竟与像多比雅这样臭名昭著、与以色列为敌的人建立家族关系这件事上，已经显得十分明显。但他殷勤逢迎的举动还远不止此；因为为了在多比雅偶尔到访耶路撒冷时接待这样一位重要人物，以利亚实竟在圣殿里为他预备了一间华美的住处。如此严重的不当之举之所以会被引进来，除了设想在祭司不在场、圣殿事奉停止的期间，圣殿被看作普通公共建筑，因此在当时情形下可以挪作宫殿式住宅之外，无法以别的方式解释。
第5节 尼希米记 13:5 便为他预备了一间大屋子，就是从前收存素祭、乳香、器皿，以及照命令供给利未人、歌唱的、守门的五谷、新酒和油的十分之一，并归祭司举祭的地方。 JFB对本节无注释。
第6节 尼希米记 13:6 那时我不在耶路撒冷；因为巴比伦王亚达薛西三十二年，我回到王那里；过了多日，我向王告假。那时我不在耶路撒冷。以利亚实认为，尼希米既已离开耶路撒冷，并且在他被准许离任的期限满后辞去了治理职分，便是不再回来，于是开始大肆放纵自己；既然再没有人是他所惧怕其权威或脸色的，他就任意行出许多极不配他圣职的事。这些事固然与他自己不敬虔的品格相合，但在这位敬虔省长居住期间，他是不敢尝试的。尼希米作耶路撒冷省长共十二年；在成功修筑并重新加固这城之后，期满便回到书珊履行他的职责。在巴比伦王亚达薛西三十二年。
（参见以斯拉记 6:22 的注释。）他在那里停留多久，经文没有明说；但“过了多日”这句圣经中的说法，通常表示一年或若干年；后来他得到许可，重新回到耶路撒冷执政，却带着极深的痛心与遗憾，发现事情已经败坏混乱到这里所描写的地步。如此严重的不规矩，如此惊人的败坏竟然潜入进来，显然表明已经过了相当长的时间。此外，这也把大祭司以利亚实的品格暴露在极其不利的光中；因为按其职分，他本该维护圣殿及其器物不可侵犯的神圣性，而他的影响却被直接用来作恶；尤其是，他竟许可并纵容一件极其不体面的亵渎之事，就是把圣殿中最好的房间拨给一位异教省长居住，这人又是神的百姓和对神敬拜最坏、最顽固的仇敌之一。
尼希米第二次回来时所决心施行的第一项改革，就是制止这种严重的亵渎；而那间因这拜偶像的亚扪人居住而被玷污的房间，在经过礼仪上的洁净之后（民数记 15:9），又恢复其本来的用途，作为收存圣器的库房。
第7-9节 尼希米记 13:7-9 我来到耶路撒冷，就知道以利亚实为多比雅所行的恶事，便是为他在神殿的院内预备屋子。 JFB对这些经文无注释。
第10节 尼希米记 13:10 我见利未人所当得的分无人供给他们，甚至供职的利未人与歌唱的俱各奔回自己的田地去了。 我见利未人所当得的分无人供给他们。百姓因厌恶以利亚实的侵吞滥用，或因圣礼执行得松弛失序，就扣住了什一之物，以致这些宗教职事人员为了生计，不得不退回乡间自己的祖业；圣殿的事奉停止了；一切宗教本分都被忽略了；而放进圣库中的钱财却被挥霍在款待一个亚扪异教徒身上，这人还是公然藐视神和他百姓的仇敌。省长回来之后，这些可耻而亵渎的行为便告终止。他严厉斥责那些受托管理圣殿及其事奉的祭司们（这里没有提到以利亚实，很可能他已经去世），因为他们完全忽略自己的本分，也违背了他离开时向他所作的庄严承诺。他严正地指控他们，不但扣留了人所应得的，也因忽视神殿和神事奉的照管而抢夺了神。这样，他既唤醒他们的责任感，又激励他们以重新委身于圣工来见证自己因犯罪疏忽而生出的敬虔忧伤；于是尼希米召回分散的利未人，使他们照常履行职责，从而恢复了圣殿的事奉。与此同时，百姓看见他们的奉献不再被挪作不当用途，便如从前一样甘心送来什一之物。又选派诚实且有美名的人作圣物宝库的监督；于是秩序、规整和积极的事奉便重新在圣殿中建立起来。
第11-14节 尼希米记 13:11-14 我就斥责官长说，为何离弃神的殿呢？我便招聚利未人，使他们照旧供职。 JFB对这些经文无注释。
第15节 尼希米记 13:15 那些日子，我在犹大见有人在安息日榨酒，搬运禾捆，驮在驴上；又把酒、葡萄、无花果和各样的担子，在安息日担入耶路撒冷；我就在他们卖食物的那日警戒他们。 那些日子，我在犹大见有人在安息日榨酒。圣殿事奉的停止，必然接着带来公众对安息日的亵渎；而这种情形已经严重到一个地步，以致田间照常劳作，鱼也在这圣日被带到市场上。尼希米采取了果断的措施，下令关闭城门，直到安息日过去才可开启；为确保这命令切实执行，他又派自己的一些仆人把守，防止那日有任何货物被运进城。商人和各种贩子见不得入城，便在城外支搭棚子，盼望仍可与乡民做买卖；但省长警告他们，若再继续这样，他就要采取强硬措施把他们赶走。为此，又派一班利未人在城门口站岗守望，并授予酌情权，以维护安息日的圣洁。
第16-23节 尼希米记 13:16-23 又有推罗人住在耶路撒冷；他们把鱼和各样货物运进来，在安息日卖给犹大人，甚至在耶路撒冷也是如此。 JFB对这些经文无注释。
第24节 尼希米记 13:24 他们的儿女说一半亚实突的话，不会说犹大语，所说的是照着各族的方言。 不会说犹大语，所说的是照着各族的方言，就是一种混杂的土语，是从他们母亲那里熏染来的，同时也带来了外邦的原则和习俗。
第25节 尼希米记 13:25 我就斥责他们，咒诅他们，打了他们几个人，拔下他们的头发，又叫他们指着神起誓，说，你们不可将自己的女儿嫁给他们的儿子，也不可为自己和儿子娶他们的女儿。 咒诅，[ 'ªqalleem (H7043)]，就是严厉地责骂他们。打了……又拔下他们的头发。剪去犯罪者的头发，似乎是一种比起严酷更偏向羞辱的惩罚；然而也有人认为，羞辱之外还加上了痛苦，因为他们是用暴力扯下头发，就像活拔禽鸟的羽毛一样。
第26-30节 尼希米记 13:26-30 以色列王所罗门不是在这样的事上犯罪吗？在多国中并没有一王像他，且蒙他神所爱，神立他作全以色列的王；然而连他也被外邦女子引诱犯罪。 JFB对这些经文无注释。
第31节 尼希米记 13:31 我又派百姓按定期献柴，并献初熟的土产。我的神啊，求你记念我，施恩与我。 这为求神赐福而发的祷告，是尼希米常常随即说出并写下来的；表达了他热切的愿望，或是盼望那些背道的祭司受惩罚，并且照着旧约时代的精神，使他自己热心的服事得蒙承认和赏赐。尼希米在这些重要改革之后又活了多久、治理了多久，圣史并未告诉我们；约瑟夫在《古史记》11卷5章8节中所说的，也不过是他死时已至高龄。