第1节 约拿的不顺服与惩罚。（1）“Now ...”——更严格地说，应译作“并且”；不过英文已相当充分地表达了希伯来文叙事开头的文体，不论它本身构成一卷书，还是仅仅延续一段历史记述。（参见《出埃及记》《利未记》以及其他历史书卷的开头；以西结书 1:1；并比较列王纪上 17:1 等。） 亚米太的儿子约拿——见导论。
第2节 （2）尼尼微，那大城——本书始终特别强调尼尼微城的广大。（见约拿书 3:2-3；4:11。）希腊、罗马作家所保存的传统也同样着重这一点；近代对底格里斯河左岸散布的大土阜所作的考察，更加证实了古代世界因这座城，或者更确切地说，这一组埋在土阜之下的城市群，而形成的印象。（比较创世记 10:11。） “呼喊”——这是传令官或先知发布宣告的常用词。（比较以赛亚书 40:6 等。）英文中“cry”在“宣告”意义上的用法，仍残留在“public crier（公众传呼者）”这个词里。 因为他们的恶达到我面前——“每一种罪孽在神隐秘的审判台前都有自己的声音”（大贵格利，《道德论》5卷20章，蒲赛曾引用此语）。但正如蒲赛所指出的，希伯来文尤其含有对他人作恶之意，也就是约拿书 3:8 中尼尼微人自己承认的、他们特有的那种强暴。
第3节 （3）但约拿起来逃跑——先知逃跑的动机，由他自己说明了（约拿书 4:2）。他预见这城会悔改，也预见神要向它施怜悯；因此，他或者是顾惜自己先知的名声，或者是出于爱国之情，不愿成为向这样一个对本国极其可怕的外邦仇敌传递好信息的人。他施——这几乎不可能是别处，只能是他施施，即古代腓尼基人在西班牙西南部瓜达尔基维尔河上的殖民地。（见创世记 10:4；历代志上 1:7。）约拿选择这个避难所，含有深刻的道德教训。一个企图逃避清楚认识到之责任的人，尤其是在当时还能给良心找出似是而非借口的人，他原先地位越高，就越有危险跌得更低。约拿奉命往东北远方的尼尼微去，却立刻要逃往当时最遥远的西方。圣徒般的高处与罪恶深渊之间，往往没有中间可停歇之地。怀有最高理想的人，一旦对理想不忠，往往会比普通人沉沦得更深。
躲避耶和华的面——更准确地说，是“躲避耶和华的面前”。这话可能含有以下意思：（1）相信有可能躲避神的眼目（如创世记 3:8），这种观念从诗篇 139 篇对其反面的强调可见，在民间思想中留存甚晚；（2）放弃先知职分。（比较申命记 10:8；列王纪上 17:1）；（3）逃离圣地，因为人们以为神的同在特别彰显于那里。注释家一般拒绝第一种解释，认为那样就意味着一种不配先知有的无知；但约拿上船后又下到底舱，好像要藏得更稳妥，并且他对水手也用了同样的表达，而水手当然会按字面和通俗意义去理解。约帕——希伯来文作 Yapho；今名雅法，是耶路撒冷的港口。（见约书亚记 19:46；历代志下 2:16。） 他遇见一只船——大概是一艘往来埃及与西班牙之间、惯常停靠约帕的腓尼基商船。
第4节 （4）发出——希伯来文这个词（见旁注，并比较约拿书 1:5、1:12、1:15，同一个词在那里译作“抛出”）表达的是暴风骤然爆发之意。一阵狂风袭击了船只。那一带海岸素为航海者所知，极其危险。（见约瑟夫《古史》15卷9章6节，《犹太战记》3卷9章3节。） 甚至船几乎破坏——旁注保存了字面的说法，这是水手的表达，把船看作有生命、有情感、有盼望也有惧怕之物。关于“破坏”一词用来指船只失事（比较 naufragium），见列王纪上 22:48。
第5节 （5）各人哀求自己的神——若这些水手是腓尼基人，他们就会敬奉本民族万神殿中的宠爱神明；但他们也可能是一群由不同民族组成的杂色船员。关于这种惊惶，可比较诗篇 107:23-30，以及莎士比亚《暴风雨》中的话：“全完了！祷告！祷告！全完了！” 货物——希伯来文是泛指各种器具、物件，因此包括船上所有可移动之物。至于货载，大概会像保罗遇船难时那样，留到最后关头才处理。为了使船轻些——这表达了意思，不过希伯来语习惯用法似乎是“使他们自己得轻省”。（比较出埃及记 18:22，“这样你就轻省些”；列王纪上 12:10，“请你使我们轻松些”。） 船的里面——更准确地说，是“隐密处”。这词可用于圣殿的内室（列王纪上 6:16）、洞穴（撒母耳记上 24:3）、住宅（诗篇 128:3）。
船——这里的希伯来词与本节前面所用的不同，而且只见于此处。它由一个意思是“用板遮盖”的词根而来，指的是有甲板的船。约拿已下到底舱里去，这对一个逃避痛苦责任的人来说是极其自然的举动。若站在甲板上，看着岸边慢慢远去，对他将是一种精神折磨。沉沉睡了——这深沉的睡眠，可以由他仓皇奔向海边所致的疲惫来解释。同样的说法也用于西西拉（士师记 4:21）。此外，当一个决定一旦被视为不可挽回地定下后，良心就不再用警醒的警告来搅扰人，而悔恨的不安也尚未到来。人有一个短暂的时刻，可以“从自己那里流亡而逃”。
第6节 （6）船主——直译是“那些作绳索之工的首领”。犹太人的航海术语并不多，因此往往难解。约拿书 1:5 中“水手”所对应的词，从其在以西结书 27:8、27:27、27:29 的用法，以及其词源（由“盐”而来；比较“老水手”这一说法）来看，似乎是泛指航海的人。“作绳索之工的人”则可能是“掌舵的”或“桅顶上的人”，有别于划桨者。 你这睡觉的人哪，怎么这样呢——直译是“睡觉的，这与你有什么相干？”意思是：你怎么还能睡得这样沉？ 提出这问题的动机，无疑一方面是需要同情，如门徒在马可福音 4:38 的情形；另一方面则是相信先知的祷告有效。这种信念似乎并不单单出于迷信的恐惧，怕有哪位神明被忽略，而也出于一种模糊的感觉，就是以色列的神尤其伟大、良善。这里所用的称呼是 ha Elohim，即“那位神”。
第7节 （7）来吧，我们掣签——我们应当设想，约拿听从船长的请求来到甲板上，也加入船员们一同祈祷。见一切都无效之后，水手们便提议诉诸古老习俗，借掣签找出那位惹众神如此愤怒的罪人。古典作家与圣经（比较约书亚记 7:14 以下；撒母耳记上 14:36-46）都提供了许多例证，说明人们相信，不敬虔之人的存在会使所有与他同行的人一同遭受无差别的灭亡。这种情绪自然在海上表现得尤为强烈。 “谁若今日把厄琉息斯的礼仪拖来， 那人就永不得入我家， 也不得与我同航；屋顶会坍塌， 船只会毁坏；正直人与盗贼， 常常都被被忽视的公义一并混淆。” 贺拉斯：《颂诗》3卷2首26-30行（康宁顿译）。 又可比较西塞罗所讲的狄阿哥拉斯的故事（《论神性》3:3），埃斯库罗斯《七将攻忒拜》601-604行，索福克勒斯《安提戈涅》372行以下。
第8节 （8）“为了谁的缘故……”——希伯来语习惯说法很特别，原是“为着谁的缘故归于谁”；但本节中，当水手对先知说话时，这个表达比上一节他们彼此说话时更为雅致，这是本叙事艺术完善性的许多细节标记之一。确实，有些抄本省略了这一重复发问，因此有些注释家把它看作后人所加。但这种重复完全自然。水手见签竟落在一个外表如此不可疑的人身上，便急于借着他的承认来证实此事。同样自然的，还有这连珠炮似的急切发问。（比较维吉尔《埃涅阿斯纪》8:112, 113。）
第9节 （9）他说——“这紧急局面使约拿回到真实的自己。如今他性格中较好的一面全都显露出来。他在本章余下部分的举止庄重而有男子气概，配得上作耶和华的仆人和先知”（佩罗恩）。 我是希伯来人——原文次序更有力：“希伯来人，我是。”七十士译本作“主的仆人”。 那创造……的——这些话表明先知身上已经发生了极大的变化。他现在感到，要躲藏、要逃避宇宙万有之创造主，是何等徒然。但他说这话也是为了船员们；他们虽然承认耶和华是以色列支派的神，却从未真正认识到，祂与他们自己也有关系，因为祂是他们所居世界的创造主，也是他们所航行之海的创造主。风暴宣讲了神的全能。
第10节 （10）你做的是什么事呢——与其译作“你为什么……”，不如译作“你做的这是什么事呢？”这问题表达的是惊骇，不是好奇。 因为众人已经知道——约拿在约拿书 1:9 的回答，显然只是他实际回答内容的简略摘要。
第11节 （11）我们当向你怎样行呢——先知当然知道，当如何平息那位被他触怒之神。 使海浪平静归于我们——见旁注。这里译作“平静”的词，在诗篇 107:30 中指风暴之后的平静，在箴言 26:20 中则比喻争端后的和睦。 翻腾不息——直译是“正在去，并且正在翻腾”，旁注已正确解释了这一习惯用法。（比较创世记 8:3 的类似表达。）
第12节 （12）把我抛在海中——约拿并不需要先知性的默示，才能对自己下这样的判语。他极有男子气概，宁愿自己灭亡，也不愿让别人因自己的败坏而遭殃。
第13节 （13）竭力荡桨——这样翻译希伯来动词已经足够，虽然失去了原有的比喻意味。这个词在其他所有用例中，都指用强力突破墙壁或围障。（见以西结书 8:8；12:5；12:7；约伯记 24:16；阿摩司书 9:2；并比较其派生名词在出埃及记 22:2；耶利米书 2:34 中的用法。）把船强行穿过巨大浪墙的形象极其鲜明。拉丁文 infindere sulcos 和英文的 ploughing the main（犁开大海）是同类比喻。这些水手有一个美好的品格，就是在一切拯救船只的努力都试尽之前，他们不肯照先知的请求把他抛下海去。
第14节 （14）因此他们求告耶和华——这里以及本书通篇，都呈现出鲜明对比：外邦人乐于接受宗教印象，以色列人却顽梗固执。 不要因这人的性命使我们灭亡——也就是，不要因我们取了他的性命而使我们灭亡。报应之律对他们与对希伯来人一样熟悉（申命记 19:21）。（比较撒母耳记下 14:7。） 因为你——原文更有力量：“因为你，耶和华啊，照你所喜悦的已经行了。”风暴、掣签，以及先知本人的请求，都表明水手不过是执行神旨意的工具。
第15节 （15）狂浪就平息了——比较奥维德《变形记》1:330 的 maris ira，贺拉斯《短歌》2:57 的 iratum mare。 “因他的重负， 发怒的海洋翻腾起沫。” 莎士比亚：《安东尼与克娄巴特拉》。
第16节 （16）献祭——船上也许有适合献祭的活牲口；但祭物只能在靠岸后完成献上，因此他们就许愿。
第17节 （17）耶和华——在希伯来文中，约拿书第2章实际上是从本节开始的。 预备——用过去完成时会误导人。应译作“指定”或“安排”，并比较约拿书 4:6-8，那里同一个词用于蓖麻、虫子和东风。钦定本在约伯记 7:3；但以理书 1:5-10 中也准确地译出了这个词。这里并不意味着预先特别准备，更不是为此特殊目的而创造。神使用现有的工具来成就祂的旨意。 一条大鱼——希伯来文 dag 一词源于鱼类多产的特性，所以“大鱼”可以指任何海中巨兽。认为它是鲸鱼的观念，源于七十士译本和马太福音 12:40。但 κῆτος 一词可指任何大鱼，如海豚、鲨鱼等。（见荷马《奥德赛》12:97。）除非我们事先已经决定了这样一个问题，即《约拿书》是否被圣经作者意在写成一段字面历史，或是一则根据历史而作的寓言，或是纯粹的比喻，否则正如一位古老注释家所说，关于“约拿之鱼”的整段讨论，看起来都是空泛而无益的。注释家提出的解释，大致分为严格超自然的，如为此时此刻创造了一条鱼；以及自然或半自然的，如那其实是一艘船，或是一家挂着鲸鱼招牌的客店，或是一条白鲨。（关于最后一种假说，可参阅蒲赛《约拿书注释》中所搜集的一切材料。）在早期基督教绘画中，这怪物被画成一条巨龙。 三日三夜——见马太福音 12:40，《新约注释》。